Sistem ekskresi pada manusia tidak selamanya dapat berjalan secara normal. Pada kondisi tertentu, sistem tersebut dapat mengalami kelainan sehingga mempengaruhi kerja alat tubuh lainnya. Berikut ini beberapa kelainan/penyakit yang terjadi pada sistem ekskresi manusia.
a. Nefritis
Nefritis (radang ginjal) merupakan penyakit yang disebabkan oleh infeksi bakteri Streptococcus. Nefritis kronis sering kali terjadi pada orang lanjut usia (manula). Penyakit ini ditandai dengan tekanan darah yang tinggi, pengerasan pada pembuluh darah ginjal, serta kerusakan pada bagian glomerulus dan tubulus.
Kerusakan glomerulus dapat menyebabkan urea dan asam urat masuk kembali ke dalam darah. Peristiwa demikian disebut uremia. Adanya urine di dalam darah dapat menyebabkan terganggunya proses penyerapan air sehingga terjadi penimbunan air di kaki atau disebut edema.